Genetic and phylogenetic analysis of Cytochrome b region in Red Deer

Aghazadeh, Leila and Nikbin, Saeid (2017) Genetic and phylogenetic analysis of Cytochrome b region in Red Deer. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
H-00076-AB.pdf

Download (933kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

In this research, the Persian Red Deer (Maral) populations and other species and subspecies of Cervus (40 samples of all populations) were studied. The genomic DNA was extracted from bone, tissue, blood and hair samples. The specific primers were used to amplify Cytochrome B region the mitochondrial DNA (mtDNA). The fragment (1140 bp) was amplified by PCR, and the PCR products were sequenced. Analysis of the fragment sequences revealed that among the different studied species, the Persian Maral has the least genetic distance with Cervus elaphus maral Bako (0.006179), while it showed the most genetic distance with Cervus elaphus Canadensis (0.059742). The results of phylogenetic analysis using the Neighbor-Joining method showed that the Persion Red Deer has not mixed genetically with the other deer populations.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه سیتوکروم b گوزن قرمز
Persian Abstract: در اين تحقيق جمعيت¬هاي گوزن قرمز ایران (مارال) و سایر گونه ها و زیرگونه های آن در سایر کشورها ( 40 نمونه از تمامي جمعيت¬ها) مورد نمونه برداري قرار گرفت و پس از استخراج DNA از نمونه¬هاي استخوان، بافت، خون و مو یک جفت پرايمر اختصاصی براي تکثیر قطعه 1140 جفت باز از ناحيه سیتوکروم b DNA ميتوكندريایی، طراحي گرديد. سپس ناحيه هدف توسط PCR تكثير و محصول حاصله مورد توالي¬يابي قرار گرفت. نتایج توالی¬ها در این تحقیق نشان داد که در بین گونه هاي مختلف گوزن، مارال کمترین فاصله ژنتیکی، که معادل 0.006179 است را با گونه Cervus elaphus maral Bako (گوزن قرمز آسیایی) دارد، در حالی که بیشترین فاصله ژنتیکی مارال باCervus elaphus Canadensis USA (گوزن قرمز آمریکایی) معادل 0.059742 می باشد. همچنين نتايج آزمون فيلوژنتيكي با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد كه گوزن قرمز ايراني، اختلاط ژنتيكي با گوزن¬هاي سایر کشورها نداشته و اين جمعيت خالص و مجزا از سایر جمعیت¬های مورد بررسی مي باشد.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 01 Dec 2018 16:55
Last Modified: 01 Dec 2018 16:55
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4120

Actions (login required)

View Item View Item