Genetic and phylogenetic analysis of D-Loop region in Red Deer

Aghazadeh, Leila and Nikbin, Saeid (2017) Genetic and phylogenetic analysis of D-Loop region in Red Deer. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
H-00076-AC.pdf

Download (873kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

In this study, populations of Persian Red Deer (Maral) and other species subspecies of Cervus (45 samples of all populations) were investigated. The genomic DNA of the samples were extracted from bone, tissue, blood and hair; A pair of specific primers were applied to amplify a fragment (602 bp) of the D-Loop region of mtDNA. Then, the PCR products were sequenced. The results of the sequenc showed that Maral has the least genetic distance (0.03281) with Cervus elaphus wapitoid, while it showed the greatest genetic distance with Cervus Nippon (0.692332). The results of phylogenetic analysis using the Neighbor-Joining method showed that the Persian Red Deer has no mixed genetically with the other deer populations.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-Loop گوزن قرمز
Persian Abstract: در اين تحقيق جمعيت¬هاي گوزن قرمز ایران (مارال) و سایر گونه ها و زیرگونه های آن در سایر کشورها ( 45 نمونه از تمامي جمعيت¬ها) مورد بررسی قرار گرفت و پس از استخراج DNA از نمونه¬هاي استخوان، بافت، خون و مو، یک جفت پرايمر اختصاصی براي تکثیر قطعه 602 جفت بازی از ناحيه D-Loop DNA ميتوكندريایی، تکثیر گرديد. سپس ناحيه هدف توسط PCR تكثير و محصول حاصله مورد توالي¬يابي قرار گرفت. نتایج آنالیز توالي¬ها در این تحقیق نشان داد که در بین گونه هاي مختلف گوزن، مارال کمترین فاصله ژنتیکی، که معادل 0.03281 است را با گونه Cervus elaphus wapitoid دارد، در حالی که بیشترین فاصله ژنتیکی مارال با Cervus Nippon معادل 0.692332 می باشد. همچنين نتايج آزمون فيلوژنتيكي با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد كه گوزن قرمز ايراني، اختلاط ژنتيكي با گوزن-هاي سایر کشورها ندارد.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 01 Dec 2018 16:54
Last Modified: 01 Dec 2018 16:54
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4121

Actions (login required)

View Item View Item