Investigation of NPY and HSP70 genes polymorphisms and their associations with reproductive traits of indigenous turkeys.

Rasti Doust, Niloofar (2018) Investigation of NPY and HSP70 genes polymorphisms and their associations with reproductive traits of indigenous turkeys. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img]
Preview
Text (بررسی چند شکلی ژن های HSP70 و NPY و ارتباط آن با صفات تولید مثلی بوقلمون های ایران)
Niloofar Rasti Doust.pdf

Download (748kB) | Preview
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

The aim of this study was to sequence and investigate the association of HSP70, NPY genes, and reproductive traits in indigenous turkeys in northwestern Iran. The traits include egg weight, egg number, laying period length, age of first egg, mean egg weight and total egg weight. Samples were taken from turkey hens of East Azarbaijan research station (Tartar Breeding Center). Blood samples of the turkeys were used for DNA extraction. Specific primers were used for amplifying 725 and 327 bp of the NPY and HSP70 genes, respectively, by PCR using. The polymorphisms of the genes was investigated using SSCP and then sequencing of PCR products. Five polymorphisms was observed in the NPY gene (C550T A546T, A436G, T360G, A367C). Each of the five polymorphisms showed three possible genotypes. For NPY gene the CC genotype of 367 showed the highest frequency, and the highest heterozygosity was observed at 436. Only two genotypes, AA and AG, were obtained at A161G for the HSP70 gene. In the present study, the highest allele frequency were G alleles (0.7783), in the position 360bp, alleles C (0.9130) of the position 367bp, G alleles (0.7179) at the position 436bp, T allele (0.8547) at 546bp, and alleles C (0.8301) at 550bp, for the NPY gene. Allele G of the HSP70 gene (0.9413) was the highest. Statistical analysis results showed a significant association between NPY gene T360G position and total egg weight and mean egg weights. The A546T position was significantly associated with egg number, egg weight, laying period length and mean egg weight. Also, GG genotype of A161G of HSP70 gene significantly increased the mean egg weight and the first egg weight. These results suggest that the polymorphisms of NPY and HSP70 genes in indigenous turkeys of northwestern Iran have a significant association with egg production traits, and can be considered as candidate genes for reproductive traits in breeding programs for indigenous turkeys of Iran.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی چند شکلی ژن های HSP70 و NPY و ارتباط آن با صفات تولید مثلی بوقلمون های ایران
Persian Abstract: هدف از انجام این مطالعه توالی یابی و بررسی ارتباط ژن هایHSP70 وNPY با صفات تولیدمثلی در بوقلمون¬های بومی شمال غرب ایران است. این صفات شامل وزن توده¬ی تخم تولیدی ،تعداد تخم تولیدی ،طول دوره¬ی تخم-گذاری، سن بلوغ جنسی ،میانگین وزن تخم و وزن اولین تخم می¬باشد. به منظور شناسایی چندشکلی های این ژن-ها نمونه¬های خون120قطعه بوقلمون از ایستگاه تحقیقاتی آذربایجان شرقی تهیه شد و استخراج DNA انجام شد سپس تکثیر قطعه¬های 725 و 327 جفت بازی بترتیب ژن¬های NPY و HSP70توسط PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی برای هر کدام انجام گرفت. چندشکلی قطعات ژن های مورد بررسی با استفاده از روش SSCP و توالی یابی محصولات PCR مورد بررسی قرار گرفت. . برای هر کدام پنج جایگاه چند شکلی مشاهده شده در NPY (C550T ، A546T ، A436G، T360G ، A367C )هر سه ژنوتیپ ممکن رانشان دادند. بالاترین فراوانی ژنوتیپی مربوط به ژنوتیپ CC از جایگاه 367 بود و بیشترین هتروزیگوسیتی در جایگاه 436 مشاهده شد. برای ژن HSP70 تنها دو ژنوتیپ AA و AG در جایگاه A211G بدست آمد. در پژوهش حاضر برای ژن NPY در جایگاه 360 آلل G با فراوانی 0.7783، جایگاه 367 آلل C با فراوانی 0.9130 ،در جایگاه 436 آلل G با فراوانی 7179/ 0،جایگاه 546 آلل T با فراوانی 8547/0 و در جایگاه 550 آلل C با فراوانی 8301/0بیشترین میزان فراوانی را نشان دادند و برای ژن HSP70 آلل G با فراوانی 9413/0 بیشترین فراوانی را داشت. نتایج آنالیز آماری وجود ارتباط معنی داری بین جایگاه T360G ژن NPY و صفات وزن کل تخم و تعداد تخم نشان می دهد. جایگاه A546T این ژن ارتباط معنی داری با صفات تعداد تخم ،وزن کل تخم و طول دوره ی تخمگذاری نشان داد. همچنین ژنوتیپGG جایگاه چند شکلی A211G ژن HSP70 موجب افزایش معنی داری در میانگین وزن تخم و وزن اولین تخم شد. این نتایج پیشنهاد می¬کند که چندشکلی¬های ژن های NPY و HSP70 در بوقلمون¬های بومی شمال غرب ایران با وزن توده تخم و تعداد تخم ارتباط معنی داری دارد و می¬تواند به عنوان ژن های مؤثر بر صفات تولیدمثلی در برنامه های اصلاح ژنتیکی بوقلمون ایران مد نظر قرار گیرد.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Nikbin, SaeidUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Navid Shad, BahmanUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Date Deposited: 30 Sep 2018 07:18
Last Modified: 30 Sep 2018 07:18
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/137

Actions (login required)

View Item View Item