Ehtesham nia, Nayer and Razmjou, Jabrael and Naseri, Bahram and gol mohamad zadeh Khiaban, Nader and Vorburger, Christoph (2016) The Study of Genetic Variability of Geographical and Host Populations of the European Corn Borer, Ostrinia nubilalis (Lepidoptera: Crambidae) by Microsatellites markers in Iran.…. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.
![]() |
Text (مطالعه¬ی تنوع ژنتیکی جمعيت¬هاي جغرافيايي و میزبانی کرم ساقه¬خوار اروپائی ذرت (Lep.: Crambidae) (Hübner) Ostrinia nubilalis با نشانگرهای ریزماهواره در ایرا)
Nayer Ehtesham nia.pdf Download (359kB) |
Abstract
The European corn borer, Ostrinia nubilalis )Hübner( is one of the most important economic pests that could find in all parts of Iran. To study the geographical diversity, larva of this pest during 2012-2013 were collected from Ardebil, Golestan, Kordestan, East¬Azarbayjan and Sistan-Baluchestan provinces and for host diversity, from okra, melon, sugar beet, cocklebur, wheat, barley and corn from Ardabil province. By using polymerase chain reaction (PCR) and 10 different SSR primers for geographical diversity, produced 10 polymorphic sites with 100 percent polymorphism. Those markers totally produced 37 polymorphic bands in range 50 – 900 bp with mean 3.7 for every marker. Number of bands for every marker were 2 – 6. Genetic diversity analysis of the European corn borer showed significant differences within and among geographical populations and their genetic diversity based on Nei’s gene index accounted 19.2 and 80.8 percent, respectively. Maximum and minimum of genetic diversity and number of polymorphic loci were in Gorgan population 0.277, 9 and Iranshahr 0.104, 6 respectively. Maximum and minimum of heterogozysity were in Os-N3 and Os-N10 markers 0.748 and 0.203, respectively. Genetic similarity of studied geographical populations observed from 38 to 82 percent. Maximum and minimum genetic distances were observed between Sanandaj - Gorgan and Mogan - Shabstar populations 0.917, 0.198 respectively. Based on UPGMA method Mogan and Shabstar populations settled as unique in one cluster and Gorgan, Sanandaj, Iranshahr populations in another cluster. To test the correlation genetic and geographical populations distances was used Mantel test that indicated low or negative correlation (0.243 P <and r = 0.174) between genetic and geographical distances. Thus did not show correlation between increasing geographical distance in sampling sites, with their genetic distance based on SSR markers. In host populations this markers produced 32 polymorphic bands in range 50 – 900 bp with mean 3.2. Number of bands for every marker were 2 – 5. According to results, 86.92 percent of total molecular variance produced in the between populations and 13.08 percent within populations. Maximum and minimum genetic distances were observed between populations of melon - cocklebur 1.83 and wheat - barley populations 0.51. Cutting dendrogram at the maximum distance between the groups, host populations of European corn borer are attributed to two main groups that population on cocklebur in the first group and populations on okra, sugar beet, melon, wheat, barley and corn were in the second group. Second group had two subgroups, first subgroup consisted of okra, sugar beet, melon and second subgroup wheat, barley and corn.
Item Type: | Thesis (Masters) | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Persian Title: | مطالعه¬ی تنوع ژنتیکی جمعيت¬هاي جغرافيايي و میزبانی کرم ساقه¬خوار اروپائی ذرت (Lep.: Crambidae) (Hübner) Ostrinia nubilalis با نشانگرهای ریزماهواره در ایران | ||||||
Persian Abstract: | کرم ساقه¬خوار اروپائی ذرت (Hübner) Ostrinia nubilalis یکی از آفات مهم اقتصادی است که در تمام مناطق ایران یافت می¬شود. به¬منظور بررسی تنوع جغرافیایی، لاروهای این آفت طی سال¬های 91 و 92 از استان¬های اردبیل، گلستان، کردستان، آذربایجان¬شرقی و سیستان – بلوچستان از میزبان ذرت و جهت بررسی تنوع میزبانی از روی میزبان¬های بامیه، خربزه، چغندرقند، مستک، گندم، جو و ذرت از استان اردبیل جمع¬آوری شدند. با انجام واكنش زنجيره¬اي پليمراز و 10 نشانگر متفاوت ریز¬ماهواره¬ای، در بررسی تنوع جغرافیایی تعداد جایگاه¬های چند¬شکل 10 عدد و درصد چند¬شکلی 100% تعیین شد. اين نشانگرها در مجموع 37 باند چندشكل در محدوده¬ی 50 تا 900 جفت باز با ميانگين 7/3 نوار به ازای هر نشانگر توليد كردند. تعداد نوارها به ازای هر نشانگر از 2 تا 6 نوار متغير بود. تنوع ژنتيكي درون و بين جمعيت¬هاي جغرافيايي کرم ساقه¬خوار اروپائی ذرت، معني¬دار و تنوع ژنتیکی درون جمعیتی و بین جمعیتی براساس ضریب تشابه نی، به-ترتیب 8/80% و 2/19% برآورد گردید. بیشترین و کمترین میزان تنوع ژنی و تعداد جایگاه¬های چند¬شکل به¬ترتیب مربوط به جمعیت¬های گرگان 277/0، 9 و ایرانشهر 104/0، 6 بودند. بیشترین و کمترین میزان هتروزیگوسیتی به¬ترتیب مربوط به نشانگر Os - N3 و Os - N10 به میزان 748/0 و 203/0 بود. شباهت ژنتیکی جمعیت¬های جغرافیایی مورد بررسی بین 38% تا 82% مشاهده شد. بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی به ترتیب بین جمعیت¬های سنندج - گرگان و مغان - شبستر 917/0و 198/0 مشاهده گردید. براساس تجزیه خوشه¬ای با روش UPGMA جمعیت¬های مغان و شبستر در یک خوشه و گرگان، سنندج و ایرانشهر در یک خوشه مجزا قرار گرفتند. براي آزمون همبستگي فواصل ژنتيكي و جغرافيايي جمعيت¬ها، از آزمون منتل استفاده شد كه همبستگي پايين و منفي (243/0 P<و 174/0- = r) را بين فاصله¬ی ژنتيكي و فاصله¬ی جغرافيايي نشان داد. بنابراین مطابقتي با افزايش فاصله¬ی جغرافيايي محل¬هاي نمونه¬برداري، با فاصله ژنتيكي آن¬ها براساس نشانگرهاي SSR مشاهده نشد. درجمعیت¬های میزبانی اين نشانگرها در مجموع 32 نوار چندشكل در محدوده 50 تا 900 جفت باز با ميانگين 2/3 نوار به ازاء هر نشانگر توليد كردند. تعداد نوارها به ازاء هر نشانگر از 2 تا 5 نوار متغير بود. براساس نتايج حاصل، 92/86 % از كل تنوع ژنتيكي توسط تغييرات بين جمعيت¬ها و 08/13% توسط تنوع درون جمعيت¬ها ایجاد شد. بيشترين و كمترين فواصل ژنتيكي بین جمعيت¬هاي خربزه - مستک 83/1 و گندم - جو 51/0 مشاهده شد. برش دندروگرام در حداكثر فاصله بين گروه¬ها، جمعيت¬هاي ميزباني کرم ساقه¬خوار اروپائی ذرت را به دو گروه اصلي منتسب كرد. به¬طوري¬كه جمعيت¬هاي موجود در مستک در گروه اول و جمعيت های بامیه، چغندرقند، خربزه، گندم، جو و ذرت در گروه دوم قرار گرفتند. گروه دوم خود شامل دو زيرگروه بود. به¬طوري¬كه زيرگروه اول شامل جمعيت¬های بامیه، چغندرقند، خربزه و زيرگروه دوم شامل جمعيت¬هاي موجود بر روي گندم، جو و ذرت می¬باشند | ||||||
Supervisor: |
|
||||||
Advisor: |
|
||||||
Subjects: | Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection |
||||||
Divisions: | Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Plant Protection |
||||||
Date Deposited: | 29 Oct 2018 19:34 | ||||||
Last Modified: | 29 Oct 2018 19:34 | ||||||
URI: | http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/1492 |
Actions (login required)
![]() |
View Item |