A survey on relationship between cagL, orf17, cagG, and cagH genes of Helicobacter pylori cag PAI with development of gastrointestinal (GI) diseases in Iran

Raei, Negin and Negin, Saber and Latifi Navid, Saeed (2015) A survey on relationship between cagL, orf17, cagG, and cagH genes of Helicobacter pylori cag PAI with development of gastrointestinal (GI) diseases in Iran. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text (بررسی ارتباط ژن‌های cagL، orf17، cagG و cagH جزیره‌ی بیماری‌زای cag هلیکوباکترپیلوری با شیوع بیماری‌های گوارشی در ایران)
Negin Raei.pdf

Download (1MB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

Gastric cancer (GC) is the third common cancer that ends up death in the world. cag pathogenicity island (PAI) which contains genes associated with a more aggressive phenotype may involve in the pathogenesis of gastrointestinal disease. We aimed to examine the associations of cagH, cagL, orf17, and cagG genotypes of H. pylori cag PAI with severe gastrointestinal disease. A total of 242 H. pylori strains were genotyped. Histopathological examination and classification of subjects were performed. The frequencies of the cagH, cagL, cagG, and orf17 genotypes were 40/54 (74.1%), 53/54 (98.1%), 38/54 (70.4%), and 43/54 (79.6%) in patients with PU, respectively, while in the control group (NAG), the frequency was 87/147 (59.6%) for cagH, 121/146 (82.9%) for cagL, 109/146 (74.7%) for cagG, and 89/146 (61.0%) for orf17. The results of simple logistic regression analysis showed that the cagL and orf17 genotypes were significantly associated with an increased risk of PU not GC; the OR (95% CI) was 10.950 (1.446-82.935), and 2.504 (1.193-5.253), respectively. No significant association was found between the cagH and cagG genotypes and the risk of both the PU and the GC in Iran (P > 0.05). Finally, the multiple logistic regression analysis showed that the cagL genotype was independently and significantly associated with the age- and sex-adjusted risk for PU; the OR(95% CI) was 9.557 (1.219-17.185). We have concluded that the orf17 and especially cagL genotypes of H. pylori cag PAI could be as beneficial factors for the risk prediction of PU, but not GC in Iran. Keywords: H. pylori, cag PAI, genotype, peptic ulcerations, gastric cancer, Iran.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی ارتباط ژن‌های cagL، orf17، cagG و cagH جزیره‌ی بیماری‌زای cag هلیکوباکترپیلوری با شیوع بیماری‌های گوارشی در ایران
Persian Abstract: سرطان معده به عنوان سومین سرطان کشنده در جهان می‌‌باشد، جزیره‌ی بیماری‌زای cag هلیکوباکترپیلوری دارای چندین ژن می‌‌باشد که در بیماری‌های گوارشی می‌توانند شرکت کنند. هدف ما بررسی ارتباط ژن‌هایcagH، cagL، cagG و orf17 جزیره‌ی بیماری‌زای cag با بیماری‌های گوارشی در ایران می‌‌باشد. 242 سویه ی هلیکوباکترپیلوری برای تعیین ژنوتیپ های مورد نظر استفاده شدند. بررسی های پاتولوژیکی نیز انجام شده بودند. فراوانی کل ژن‌های cagH، cagL، cagG و orf17 در بیماران با زخم گوارشی به ترتیب برابر با (74.1%)54/40، (98.1%)54/53، (70.4%)54/38 و (79.6%)54/43 بودند، در حالیکه در گروه کنترل (NAG) فراوانی کل برابر با (59.6%)147/87 برای cagH، (82.9%)146/121 برای cagL، (74.7%)146/109 برای cagG و (61%)146/89 برای orf17 بود. نتایج آنالیز رگرسیون لجستیک ساده نشان دادکه ژن¬های cagL و orf17 شدیدا در ارتباط با زخم گوارشی و نه سرطان معده می‌‌باشند، (CI95%)OR به ترتیب برابر با (82.935-1.446)10.950 و (5.253-1.193)2.504 بودند. هیچ ارتباط معنی داری بین ژن‌های cagH و cagG با خطر بروز زخم گوارشی و سرطان معده در ایران یافت نشد (0.05P>= ). نهایتا آنالیز رگرسیون لجستیک چندگانه نشان داد که ژنوتیپ cagL شدیدا و به صورت مستقل از جنس و سن در ارتباط با خطر زخم گوارشی می‌‌باشد. ژنوتیپ cagL هلیکوباکترپیلوری می‌تواند به عنوان فاکتور خطر جهت پیشگویی زخم گوارشی و نه سرطان معده در ایران باشد. كليد واژه¬ها: هلیکوباکترپیلوری، جزیره‌ی بیماری‌زای cag، ژنوتیپ، زخم گوارشی و سرطان معده
Supervisor:
SupervisorE-mail
Zahri, SaberUNSPECIFIED
Latifi Navid, SaeedUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
-, -UNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions: Subjects > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Date Deposited: 30 Oct 2018 08:24
Last Modified: 30 Oct 2018 08:24
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/1571

Actions (login required)

View Item View Item