Evaluation of taxol content variation in different populations of hazelnut

Abdi, Zahra and zare, Nasser and Sofalian, Omid and Sheikhzadeh, Parisa and hedayat, shahamat (2015) Evaluation of taxol content variation in different populations of hazelnut. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text (بررسی تنوع جمعیت¬های مختلف فندق از نظر محتوی ماده¬ی دارویی تاکسول)
Zahra Abdi.pdf

Download (384kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

: Hazelnut is one of the important nut plants in north and northwest of Iran. The study of genetic diversity in different populations of hazelnut order to its utilization in improvement of this plant is very important. In this research, genetic diversity different populations collected from the Fandoglo forest (Ardabil, Ardabil province), Meshginshahr (Ardabil province) and Tarom (Zanjan province) were evaluated using random amplified polymorphic DNA (RAPD) and inter simple sequence repeat (ISSR) molecular markers. Additionally, the Taxol content of leaf samples from different populations were measured by HPLC and the relationship between molecular markers and amount of the Taxol were evaluated. In molecular analysis, 5 RAPD primers and 11 ISSR primers were produced 35 and 94 polymorphic and reproducible bands with 63 and 68 average polymorphism percentage, respectively. ¬Cluster analysis based on RAPD primers groped the genotypes into¬ three distinct groups which show a poor relation with geographic distribution. ¬Cluster analysis based on ISSR primers groped the genotypes into¬ four distinct groups. polymorphism information content (PIC), Indication(¬MI), Shannon information index( I) and Nei gene diversity (he) for a combination of two primers, respectively 0/45, 3/27, 0/65, 0/46 respectively. Overall, based on the results of this research, utilization of molecular markers especially ISSR could be helpful in determination of polymorphic regions and estimation of genetic distance between different genotypes of hazelnut. The results of taxol determination indicated that there are significant differences between genotypes in terms of taxol content.So, amount of taxol was varied from 3.82 ppm in the genotype 9 (Meshginshahr) to 0.33 ppm in genotype 14 (Ardabil). In addition, mean of taxol content of Meshginshahr, Addabil and Zanjan were 2.17, 1.36 and 1.16, respectively. The realationship between molecular markers and taxol content were assessed using stepwise regression analysis and related markers were identified. Regression relationship between molecular markers and the amount of taxol genotypes were nuts. The results indicated that markers ISSR1 (6), ISSR7 (7) and RAPD5 (6 and 9) significantly and negatively related to the taxol content while the relation between markers ISSR3 (5, 12, 15, 16), ISSR5 (1 and 3), ISSR8 (8) and RAPD1 (2), RAPD4 (8 and 17) and taxol content were positive.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی تنوع جمعیت¬های مختلف فندق از نظر محتوی ماده¬ی دارویی تاکسول
Persian Abstract: : فندق یکی از گیاهان مهم آجیلی است که در مناطق شمال و شمال‌غرب کشور کاشته می¬شود. بنابراین مطالعه تنوع ژنتیکی موجود در جمعیت‌های مختلف فندق به منظور بهره¬گیری از آن در اصلاح فندق بسیار مهم است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی جمعیت‌های مختلف فندق جمع¬آوری شده از جنگل فندقلو (اردبیل، استان اردبیل)، مشگین شهر (استان اردبیل) و طارم (استان زنجان) با استفاده از نشانگرهای مولکولی DNA چند شکلی تکثیر شده تصادفی (RAPD) و بین توالی¬های تکراری ساده (ISSR) مورد بررسی قرار گرفت. علاوه بر این، محتوای تاکسول نمونه‌ برگی جمعیت‌های مختلف با استفاده از دستگاه HPLC اندازه‌گیری شده و ارتباط بین نشانگرهای مولکولی و مقدار تاکسول مورد ارزیابی قرار گرفت. در تجزیه مولکولی، 5 آغازگر RAPD¬¬و 11 آغازگر¬ ISSR به ترتیب 35 و 94 نوار¬ چند شکل و تکرارپذیر با میانگین درصد چندشکلی 63 و 68 در ژنوتیپ‌های مورد استفاده فندق تولید کردند. تجزیه خوشه¬ای ژنوتیپ¬ها بر اساس آغازگرهای ¬RAPD¬، ژنوتیپ¬¬ها را به سه گروه مجزا تقسیم نمود که با توزیع جغرافیایی مطابقت ضعیفی نشان داد. این مسئله ممکن است به علت تعداد کم آغازگر مورد استفاده باشد. تجزیه خوشه¬ای ژنوتیپ¬ها بر اساس آغازگرهای ISSR، ژنوتیپ¬ها را به چهار گروه مجزا تقسیم¬بندی نمود. محتوای اطلاعات چند شکلی ¬¬(PIC)، شاخص نشانگر ¬(MI)، شاخص اطلاعات شانون (I) و شاخص تنوع ژنی نی (He)¬، به ازای ترکیب دو آغازگر به ترتیب 45/0، 27/3، 65/0¬ و 46/0 بدست آمد. به طور کلی بررسی تنوع در ژنوتیپ¬های فندق با استفاده از ISSR نشان داد که این آغازگر در شناسایی نواحی چند شکلی و تخمین فاصله ژنتیکی می¬تواند مفید باشد. نتایج نشان داد که بین ژنوتیپ¬های مختلف اختلاف قابل توجهی از نظر محتوی تاکسول درون سلولی وجود دارد. به طوریکه مقدار تاکسول از ppm¬¬ 82/3 در ژنوتیپ شماره 9 (مشگین شهر) تا¬¬ ppm 33¬/0¬ در ژنوتیپ¬ ¬¬14¬ (اردبیل) متغیر بود. علاوه بر این مقایسه ژنوتیپ¬های جمع¬آوری شده از سه منطقه مختلف نشان داد که میانگین تاکسول ژنوتیپ¬های مشکین شهر برابر 17/¬2 و ژنوتیپ¬های اردبیل ¬برابر 36/1 و ژنوتیپ¬های زنجان برابر 16/1 ¬است. ¬رابطه بین نشانگرهای مولکولی و مقدار تاکسول از طریق تجزیه رگرسیون گام به گام بررسی شد. رابطه رگرسیونی معنی¬داری بین نشانگرهای مولکولی و مقدار تاکسول ژنوتیپ-های فندق وجود داشت. بطوریکه نشا¬نگر 6 از¬I1 ،¬ نشانگر 7 از I7 و نشا¬نگرهای 6 و 9 از R5 دارای ارتباط منفی و نشا¬نگرهای شماره 5، 12، 15 و 16 از¬¬I3 ، نشا¬نگرهای 1 و 3¬ ¬از I5 ، نشا¬نگر 8 از I8 و نشا¬نگر 2 از¬R1 و نشا-نگرهای 8 و 17 از 4¬¬R دارای رابطه مثبت و معنی¬دار با میزان تاکسول ¬بودند.
Supervisor:
SupervisorE-mail
zare, NasserUNSPECIFIED
Sofalian, OmidUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Sheikhzadeh, ParisaUNSPECIFIED
hedayat, shahamatUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Agronomy & Plant Breeding
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Agronomy & Plant Breeding
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Agronomy & Plant Breeding
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Agronomy & Plant Breeding
Date Deposited: 16 Nov 2018 10:10
Last Modified: 16 Nov 2018 10:10
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/1854

Actions (login required)

View Item View Item