Akrami, Ania and Zahri, Saber and Latifi-Navid, Saeid (2014) Construction of a preconstruct for recombinant thermostable Carboxy methyl cellulase from the strain of Bacillus pumilus Z14. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.
![]() |
Text (ساخت پیش سازواره کربوکسی متیل سلولاز نوترکیب مقاوم به حرارت حاصل از سویه Bacillus pumilus Z14)
Ania Akrami.pdf Download (858kB) |
Abstract
The endoglucanase are industrial enzymes which their recombinantly productions are economically important. The laboratory findings showed that the enzymes from Bacillus pumilus is thermostable, active in wide pH scale range, has significant stability in presence of the ions and detergents and can hydrolyse native lignocellulosic materials of fodder. In order to heterologous production of the enzyme, the pET21-b(+) expression vector was selected. The vector has important features for heterologous expression including: strong and regulative promoter, suitable multiple cloning site and histidine tag in downstream of cloning site. The two specific tailed primers was designed to amplify the ORF of the gene from B.pumilus Z14 which was included two restriction sites of BamHI-5ˊ and XhoI-3ˊ. In order to increment of restriction efficiency and future modifications of the gene, an expression preconstruct was prepared by cloning of the PCR fragment in vector pTG19-T. The recombinant molcules were transformed in E.coliDH5α using heat shock/CaCl2 method. The correct colonies were selected using blue/white screening and toothpick methods. The recombinant molecule was confirmed by appropriate restriction endoglucanase digestion. The insert was cloned in pTG19-T between two digestion sites of BamHI and digestion with the restriction enzyme produced two linear fragment. The lower band was matched to the size of the full length gene. Keywords: Bacillus pumilus, Cloning, Endoglucanase, Expression vector, Heterologous expression, Preconstruct.
Item Type: | Thesis (Masters) | ||||
---|---|---|---|---|---|
Persian Title: | ساخت پیش سازواره کربوکسی متیل سلولاز نوترکیب مقاوم به حرارت حاصل از سویه Bacillus pumilus Z14 | ||||
Persian Abstract: | آنزیم اندوگلوکاناز یک آنزیم صنعتی با کاربرد فراوان است که تولید نوترکیب آن میتواند ارزش افزوده اقتصادی قابل توجهی داشته باشد. یافته های آزمایشگاهی نشان داد که این آنزیم دارای تحمل دمایی بالا، طیف فعالیت pH وسیع بوده و از پایداری نسبتا خوبی در مقابل یونها و دترجنتها برخوردار است و به دلیل داشتن توانایی هیدرولیز سوبستراهای طبیعی، درخوراک دام و تجزیه مواد لیگنوسلولزی کاربرد دارد. جهت بیان نوترکیب این آنزیم از وکتور pET21b(+) به دلیل داشتن ویژگی های قابل توجه از جمله: پروموتر قوی، تحت تنظیم بودن، جایگاه پلی لینکر مناسب و تگ هیستیدینی به عنوان کاست بیانی استفاده شد. به منظور طراحی پرایمر از ناحیه ORF ژن اندوگلوکاناز سویه Bacillus pumilus Z14 استفاده شد. قطعه حاصل از تکثیر ژن اندوگلوکاناز مطابق با ماهیت پرایمرهای طراحی شده دارای جایگاه های برشی BamHI در انتهای ˊ5 و IXho در انتهای ˊ3 بود. با وجود سه نوکلئوتید اضافی در فرادست پرایمرها، برای افزایش کارامدی برش و نگهداری کپی توالی ژنی جهت تغییرات و موتاسیو ن های توسعه دهنده عملکرد آنزیم، نیاز به تهیه پیش سازواره اولیه از ژن تکثیر شده بود که به این منظور از وکتور pTG19-T به عنوان پایه کلونینگ T/A استفاده شد. جهت کلونینگ ژن اندوگلوکاناز در وکتور pTG19-T، مخلوط ligation از طریق شوک حرارتی در سلول های E.coliDH5α ترانسفورم گردید. کلنی های نوترکیب توسط محک غربال گری آبی/ سفید جداسازی و با آزمون toothpick شناسایی شدند. در نهایت به منظور تایید کلونینگ از هضم پلاسمید نوترکیب توسط آنزیم های محدود کننده استفاده شد. با توجه به توالی وکتور pTG19-T، قطعه وارد شده در حد فاصل دو جایگاه برشی BamHI قرار گرفته بود که در صورت برش با آنزیم IBamH دو قطعه DNA خطی شامل وکتور و ژن خارجی تولید شد که اندازه باند مربوط به قطعه ژن خارجی با اندازه ژن اندوگلوکاناز تکثیر شده، مطابقت میکرد که تاییدی بر صحت کلونینگ بود. كليد واژه¬ها: آنزیم اندوگلوکاناز، باسیلوس پومیلوس، بیان نوترکیب، پیش سازواره، کاست بیانی، کلونینگ ژن. | ||||
Supervisor: |
|
||||
Advisor: |
|
||||
Subjects: | Faculty of Basic Sciences > Department of Biology Divisions > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology |
||||
Divisions: | Subjects > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology Faculty of Basic Sciences > Department of Biology |
||||
Date Deposited: | 13 Dec 2018 14:27 | ||||
Last Modified: | 13 Dec 2018 14:27 | ||||
URI: | http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/2301 |
Actions (login required)
![]() |
View Item |