A survey on relationship between Helicobacter pylori virulence genotypes and development of gastric adenocarcinoma in Ardabil province

Abdi, Esmat and Latifi-Navid, Saied and Zahri, Saber and Yazdanbod, Abbas (2015) A survey on relationship between Helicobacter pylori virulence genotypes and development of gastric adenocarcinoma in Ardabil province. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text (بررسی ارتباط ژنوتیپ‌های بیماری زای هلیکوباکترپیلوری و بروز آدنوکارسینومای معده در استان اردبیل)
Esmat Abdi.pdf

Download (509kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

Helicobacter pylori (H. pylori)-specific genotypes play an essential role in the development of gastric cancer (GC). Association between H. pylori virulence genes and GC has not been reported in Ardabil province, which is one of the areas with the highest GC incidence rate in the world. In this study, we investigated the H. pylori vacA gene polymorphisms and their association with GC in Ardabil. Genomic DNA from gastric tissue of 135 H. pylori infected patients was extracted and classified into two groups: non-atrophic gastritis, NAG (n = 57) and GC (n = 87). Amplification of the H. pylori 16S rDNA gene, and vacA s/-m/-i/-d region genotypes was performed by PCR. Occurrence of H. pylori infection in our study population was 76.29% (103/135). Results of statistical analysis showed a significant correlation between age but not gender and GC. The association between the vacA genotypes and risk of GC was assessed in the 96 patients (52 NAG and 44 GC). We found that the presence of the vacA i1 and d1 genotypes was significantly correlated with the risk of GC [adjusted OR = 9.592 (51.646-1.781), P = 0.008 and OR = 4.396 (15.375-1.257), P = 0.020, respectively). No significant association was found between the vacA s1 and m1 genotypes and risk of GC (P >0.05). In contrast, we found that the vacA m1i1, m1d1, i1d1 and m1i1d1 genotypes significantly increased the risk of GC. We have proposed that the H.pylori vacA i1 and d1 genotypes independently associated with the risk of GC, while the vacA m1 genotype in combination with the other genotypes could increase the risk of GC in Ardabil province

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی ارتباط ژنوتیپ‌های بیماری زای هلیکوباکترپیلوری و بروز آدنوکارسینومای معده در استان اردبیل
Persian Abstract: ژنوتیپ‌های خاصی از هلیکوباکترپیلوری نقش مهمی را در ایجاد سرطان معده ایفا می کنند. ارتباط بین ژن های بیماری زای هلیکوباکترپیلوری و خطر بروز سرطان معده تا به حال در استان اردبیل بررسی نشده است هر چند که این استان یکی از مناطق با بروز بالای سرطان معده در جهان می باشد. هدف ما از این مطالعه بررسی پلی مورفیسم ژن vacA و ارتباط آن با خطر بروز سرطان معده بود. DNA ژنومی از بیوپسی 135 بیمار استخراج شد و در دو گروه سرطانی (78) و گروه گاستریتی غیر آتروفی (57) طبقه بندی گردید. تکثیر ژن S rDNA16 و همچنین تکثیر ژنوتیپ‌های ناحیه ی s، m، i وd ژن vacA با استفاده از PCR انجام شد. نتایج PCR ژن S rDNA16 برای 103 بیمار (29/76 %) مثبت ارزیابی شد. آنالیز های آماری ارتباط معنی داری را بین سن (بر خلاف جنس) و خطر بروز سرطان معده نشان دادند. به منظور تعیین ارتباط بین ژنوتیپ‌های ژن vacA با خطر بروز سرطان معده، در نهایت 96 (44 بیمار سرطانی و 52 بیمار گاستریتی) بیمار وارد آنالیز گردید. نتایج آنالیز های آماری نشان داد که حضور ژنوتیپ‌های vacA i1 ]008/ 0), P = 781/1-646/51CI: 95 %) 592/9 [(adjusted OR) = و vacA d1 ] 020/ 0) , P = 257/1- 375/15CI: 95 %) 396/4 [OR = قویا خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش می دهند. نتایج آنالیز ها هیچ گونه ارتباط معنی داری را بین ژنوتیپ‌های s1 و m1 با افزایش خطر سرطان معده نشان نداد (05/0P >) زمانیکه ژنوتیپ vacA m1 به صورت ترکیب با سایر ژنوتیپ‌ها وارد آنالیز شد ارتباط معنی داری بین افزایش خطر بروز سرطان معده و ژنوتیپ‌های m1i1، m1d1، و m1i1d1 مشاهده شد. این مطالعه پیشنهاد کرد که حضور ژنوتیپ های i1 و d1 به طور مستقل و ژنوتیپ m1 در ترکیب با سایر آلل ها خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش می دهد.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Latifi-Navid, SaiedUNSPECIFIED
Zahri, SaberUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Yazdanbod, AbbasUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions: Subjects > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Date Deposited: 13 Dec 2018 16:08
Last Modified: 13 Dec 2018 16:08
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/2319

Actions (login required)

View Item View Item