Evaluation of dill (Anethum graveolensL.) genetic diversity using ISSR molecular marker

Habibollahi, Sajjad (2017) Evaluation of dill (Anethum graveolensL.) genetic diversity using ISSR molecular marker. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img]
Preview
Text (بررسی تنوع ژنتیکی گیاه شوید با استفاده از نشانگرهای ISSR و صفات مورفولوژیکی)
Sajjad Habibollahi.pdf

Download (445kB) | Preview
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

Anethum graveolens is a important medicinal-spice plant belonging to Apiaceae. In the present study, genetic diversity of accessions of dill (Anethum graveolens) was evaluated by using morphological characters and 25 ISSR markers. For this purpose, the seed of each accession was cultivated in a completly randomized design with three replications in the greenhous, then DNA were extracted from the leaves at seedling stage. The simple correlation (r) values show significant correlation among different traits. Positive correlation observed among of root length with herb height and leaf weigh. Results of cluster analysis based on morphological traits, 18 ecotype of dill classified into 3 main groups. In order to evaluate genetic diversity and relationships among of ecotype using ISSR marker, results indicated total of 480 bands with 365 polymorphism bands (%76.4). The average of PIC and RP value were 0.34 and 6.09, respectively. According to analysis of population structure the accessions were classified into 6 subpopulation (K) groups, The cluster analysis method performed 18 accessions classified into five major groups. Overall, the results of the present study indicated a reasonable genetic variation betwen of dill ecotypes, The results revealed that ISSR markers could be efficient for genetic diversity of the Anethum graveolens accessions. This genetic diversity information would be useful in the management of dill collection from centers of diversity and will assist us to select genetically distant accessions for crossing in a breeding program or can be employed as parents for the improvement of a trait.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی تنوع ژنتیکی گیاه شوید با استفاده از نشانگرهای ISSR و صفات مورفولوژیکی
Persian Abstract: شوید (Anethum graveolens L.) یکی از گیاهان دارویی- ادویه¬ای مهم خانواده چتریان می¬باشد. در این مطالعه، تنوع مورفولوژیکی و ژنتیکی شوید بر اساس 25 نشانگر ISSR در 18 اکوتیپ شوید بررسی شد. بدین منظور بذر هر اکوتیپ به¬صورت جداگانه با سه تکرار در قالب طرح کاملاً تصادفی در شرایط گلخانه کشت شد، سپس از بافت برگی آن در مرحله گیاهچه، DNA استخراج شد. نتايج ضرايب همبستگي ساده بين صفات مورفولوژيكي در بسياري از موارد معني¬دار بود، از آن جمله مي¬توان به همبستگي¬هاي مثبت بين طول ریشه و ارتفاع بوته و وزن برگ اشاره کرد. نتایج حاصل از تجزیه¬ی خوشه¬ای بر اساس صفات مورفولوژیکی، 18 اکوتیپ در 3 گروه اصلی قرار گرفتند. به‌منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط میان اکوتیپ¬ها با استفاده از نشانگر ISSR، در مجموع 480 نوار قابل امتیازدهی تولید شد که 365 نوار آن (04/76 درصد) چندشکلی نشان داد. میانگین مقدار محتوی اطلاعات چندشکلی (PIC) و قدرت تفکیک نشانگر (RP) به ترتیب 34/0 و 09/6 به¬دست آمد. اکوتیپ¬های مورد مطالعه بر اساس آنالیز ساختار جمعیت دارای 6 زیر جمعیت (K) بودند، که با توجه به آن، اکوتیپ¬ها در نمودار آنالیز تجزیه¬ی خوشه¬ای، 18 نمونه را در 5 گروه اصلی طبقه¬بندی نمود. به¬طور کلی نتایج مطالعه حاضر، تنوع ژنتیکی قابل قبولی را در بین نمونه¬های شوید نشان داد که می¬توان نتیجه گرفت که نشانگرهاي ISSR به‌طور مؤثري مي¬توانند براي مطالعه تنوع ژنتيكي نمونه¬های شوید استفاده شوند. این اطلاعات حاصل از تنوع ژنتیکی جهت جمع¬آوری شوید از مراکز تنوع مفید بوده و می¬تواند به انتخاب والدین از نمونه¬هایی که دارای فاصله ژنتیکی زیاد هستند، برای اجرای برنامه¬های دورگ¬گیری یا بهبود صفات کمک کند.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Behnamian, MahdiUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Dezhstan, SaraUNSPECIFIED
Estaji, AsgharUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Date Deposited: 03 Oct 2018 09:07
Last Modified: 03 Oct 2018 09:07
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/287

Actions (login required)

View Item View Item