Evaluation of different rice genotypes based on SSR molecular marker related to drought stress

Javadia, Golbahar and Bagheri, Nadali and Babaeiyan Jelodar, Nadali (2017) Evaluation of different rice genotypes based on SSR molecular marker related to drought stress. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
B-00287-AC-2.doc.pdf

Download (794kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

In this study, 17 different rice genotypes with tolerant controls (Arias halus, Kinandang patong) and sensitive (IR64) were evaluated using 9 molecular indicators of SSR related to drought stress in Sari University of Agricultural Sciences and Natural Resources in 2016. For this purpose, extraction of DNA was done by CTAB method for rice genotypes. Grouping of rice genotypes using SSR molecular markers related to drought stress and Jaccard's similarity coefficient with NTSYS-pc software can split rice genotypes into four groups, which are very similar in terms of appearance and genomic characteristics to Have both. the first group was semi-susceptible genotypes that had better IR64 tolerance (including Tarom-Jalodar, Neda, TM 33, DOM Zard and Tarom- mahali), the second group included genotypes sensitive to drought stress, the third group included semi-tolerant genotypes drought conditions (including Gharib Rihani, Binam, Tarom-Hashemi, Koohsar, Khazar, Arias Halus and Sefidrud genotypes ), and the fourth group included a tolerant genotype which was same control as "Kinandang patong" . In addition, TM32, Poya, IR64 and Amol- 2 genotypes were susceptible to drought stress in terms of evaluation SSR molecular marker.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: ارزیابی ژنوتیپ¬های مختلف برنج بر اساس نشانگر مولکولیSSR مرتبط با تنش خشكي
Persian Abstract: در اين مطالعه 17 ژنوتيپ مختلف برنج به همراه شاهد های متحمل (Arias halus و Kinandang patong) و حساس (IR64) با استفاده از 9 نشانگر مولكولي SSR مرتبط با تنش خشكي در دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري در سال 1395 مورد ارزيابي قرار گرفتند. بدين منظور استخراجDNA ، به روش CTAB براي ژنوتيپ¬هاي برنج انجام گرفت. گروه¬بندی ژنوتیپ های برنج با استفاده از نشانگرهای مولكولي SSR مرتبط با تنش خشكي و با ضریب تشابه جاکارد با نرم افزار NTSYS-pc توانست ژنوتیپ های برنج را در چهار گروه تقسیم بندی کند كه شباهت زيادي از نظر خصوصيات ظاهري و در سطح ژنوم با هم دارند. گروه اول ژنوتيپ¬هاي نيمه حساس كه از شاهد متحمل IR64 بهتر بودند (که شامل طارم جلودار، ندا، TM 33، دم زرد و طارم محلي می باشند)، گروه دوم شامل ژنوتيپ¬هاي حساس به تنش خشكي مي¬باشد ، گروه سوم شامل ژنوتيپ¬هاي نيمه متحمل به خشكي ( شامل ژنوتیپ های غريب¬ريحاني، بينام، طارم¬هاشمي، كوهسار، خزر، Arias Halus و سفيد¬رود) بودند و گروه چهارم شامل يك ژنوتيپ متحمل به خشكي بود كه همان شاهد متحمل یعنی Kinandang patong مي¬باشد. ضمنا ژنوتیپ¬های TM32، پويا، IR64 و آمل¬-2 حساس به تنش خشکی از لحاظ ارزیابی براساس نشانگر مولكولي SSR بودند.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 25 Nov 2018 12:18
Last Modified: 15 Dec 2018 19:38
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/3572

Actions (login required)

View Item View Item