Evaluation of genetic diversity of Black Cumin (Nigella Sativa L.) accessions using ISSR markers

Mehri, Narges and Mohebodini, Mehdi and Behnamian, Mahdi (2017) Evaluation of genetic diversity of Black Cumin (Nigella Sativa L.) accessions using ISSR markers. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
I-00090-AB-2.pdf

Download (578kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

In this study, the genetic diversity of 28 Black Cumin (Nigella sativa L.) accessions collected from different geographical regions of Iran was investigated using the Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) marker.. The 28 primers chosen for analysis revealed 243 bands, of which 162 were polymorphic. The highest polymorphic allels was belonged to the ISSR28 and UBC815 with 100% and 91.66% polymorphism, respectively. Based on UPGMA cluster analysis using simple genetic similarity coefficient, the accessions were divided into five separated groups. A principle component analysis also was conformed the results of clustering. The lowest genetic similarity was observed between Brojen and Lordegan (0.47) and Semirom and Piranshaher accessions had a highest genetic similarity , with coefficient of 0.84.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های سیاهدانه (Nigella sativa L.) با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR
Persian Abstract: در این تحقیق تنوع ژنتیکی 28 توده سیاهدانه جمع‌آوری شده از مناطق مختلف جغرافیایی ایران با استفاده از نشانگر ISSR بررسی شد. 28 آغازگر انتخاب شده برای تجزیه، از کل 243 باند ظاهر شده تقریباً 162 باند چندشکل تولید کردند. بیش‌ترین تعداد باند چندشکل متعلق به آغازگر ISSR28 و UBC815 به ترتیب با درصد چندشکلی 100 و 66/91 درصد بود. بر اساس تجزیه کلاستر UPGMA با استفاده از ضریب تشابه ژنتیکی تطابق ساده، توده‌ها به پنج گروه مجزا تقسیم شدند. تجزیه به مولفه‌های اصلی نیز نتایج تجزیه خوشه‌ای را تأیید کرد. کمترین تشابه ژنتیکی بین توده‌های بروجن و لردگان (47/0) و بیشترین تشابه ژنتیکی بین توده های سمیرم با پیرانشهر (84/0) بود.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 01 Dec 2018 16:58
Last Modified: 01 Dec 2018 16:58
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4110

Actions (login required)

View Item View Item