Bioinformatics Comparison of Prolactin Gene Between Anser and Chicken

Hosseinpour, Leyli and Nikbin, Saeid (2017) Bioinformatics Comparison of Prolactin Gene Between Anser and Chicken. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
H-00062-AC-2.pdf

Download (442kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

The aim of this study was to investigate the bioinformatics of a part of the prolactin gene (PRL) and compare it between chicken and Anser. Prolactin is a single-chain polypeptide hormone that belongs to the family of the growth hormone and was secreted by pituitary glands in vertebrates. In bird species, prolactin is a vital hormone for inducing and sustaining incubation behavior. In order to investigate the PRL gene, 9 sequences were obtained from NCBI gene banks for chicken and Anser andusing the MEGA software, these data were compared and the phylogenetic tree was mapped. For analyzing haplotypes, genetic distances, nucleotide diversity, and the mean number of nucleotide differences (K), DnaSP5 software was used. The network of haplotype relationships between species was mapped using the Network software. The results of the analysis of sequences recorded in NCBI for PRL led to the identification of 5 haplotypes and 0.806 and 0.0349 for haplotype diversity and nucleotide diversity, respectively in the studied species. Tajima D test was positive, but did not show statistically significant difference, which indicates a constant population size.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: مقایسه¬ی بیوانفورماتیکی بخشی از ژن پرولاکتین بین غاز و مرغ
Persian Abstract: هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی بخشی از ژن پرولاکتین و مقایسه¬ی آن بین مرغ و غاز می¬باشد. پرولاکتین یک هورمون پلی پپتیدی تک زنجیره¬ای است که که متعلق به خانواده¬ی هورمون رشد می¬باشد و در مهره¬داران از هیپوفیز ترشح می¬شود. در گونه¬های پرندگان پرولاکتین یک هورمون حیاتی در القاء و تداوم رفتار جوجه کشی است. به منظور بررسی ژن پرولاکتین (PRL ) تعداد 9توالی مربوط به دو گونه مرغ و غاز از بانک ژن NCBI اخذ شد و با استفاده از نرم¬افزار MEGA 6 داده¬های مزبور هم‌تراز گردید و درخت فیلوژنتیکی ترسیم شد. برای تجزیه و تحلیل هاپلوتیپ‌ها، فاصله‌های ژنتیکی، تنوع نوکلئوتیدی، متوسط تعداد تفاوت‌های نوکلئوتیدی (K) از نرم¬افزارDnaSP5 استفاده شد. شبکه روابط هاپلوتایپی در گونه‌ها نیز با استفاده از نرم افزار Network ترسیم گردید. نتایج حاصل از آنالیز توالی¬های ثبت شده در NCBI برای ژن پرولاکتین منجر به شناسایی5 هاپلوتیپ شد و به ترتیب تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی 8056/0 و 0349/0 در گونه های مورد مطالعه تعیین شد. آزمون تاجیما D مثبت به دست آمد ولی از نظر آماری تفاوت معنی¬داری نشان نداد که نشان از اندازه¬ی ثابت جمعیت دارد.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 01 Dec 2018 16:56
Last Modified: 01 Dec 2018 16:56
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4117

Actions (login required)

View Item View Item