Evolutionary analysis of Equidae family using mitochondrial genome

Omari, Mostafa and Hedayat Evrigh, Nemat and Boustan, Azadeh and Seyed Sharifi, Reza and Vahedi, Vahid and Khalkhali, Reza (2017) Evolutionary analysis of Equidae family using mitochondrial genome. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
H-00080-AB-2.pdf

Download (529kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

The source and history of horse domestication have been studied for decades in biology and archeology. Mitochondrial genome, due to the high mutation rate, lack of recombination and maternal inheritance consider as a powerful marker in phylogenetic and phylogeographic studies. This study was performed to investigate of Equidae family evolution using D-Loop sequences. To compare the evolutionary of Equidae, we used Sanger sequencing methods for horses and the sequences of Zebra and donkey were collected from NCBI database. The phylogenetic tree was constructed using maximum likelihood algorithm. The results show 16 different branches in three clusters. Based on phylogenetic tree donkey were between Zebra and domestic Horses and three groups were completely different with each other. Genetic distance parameter showed that horse and donkey have a more close relationship than Zebra. The differential between horses and Zebra base on D-loop sequences were highest.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: بررسی تکاملی اسب سانان با استفاده از ژنوم میتوکندریایی
Persian Abstract: منشأ و تاریخ اهلی شدن اسب چندین دهه در زیست‌شناسی و باستان‌شناسی مورد مطالعه قرارگرفته است. ژنوم میتوکندریایی با توجه به نرخ جهش بالا، عدم نوترکیبی و ارث‌بری مادری یک نشانگر قدرتمند در مطالعات فیلوژنتیک و فیلوژئوگرافیک به‌حساب می‌آید این مطالعه با هدف بررسی تکاملی اسب سانان با استفاده از ژنوم میتوکندریایی انجام گرفت. جهت انجام این مطالعه از توالی یابی ناحیه کنترل (D-Loop) و توالی های موجود در پایگاه NCBI برای گور خر و الاغ استفاده شد. سپس درخت فیلوژنی جهت بررسی تکاملی گونه اسب سانان ترسیم گردید که منجر به ایجاد 16 شاخه متفاوت در سه کلاستر گردید. در داخل این گراف گورخر معمولی یک گروه فشرده را به خود اختصاص داده است. اسب‌ها و الاغ با وجود اینکه در گروه متمایزی قرار داشتند نسبت به گورخر از لحاظ تکاملی نزدیک به هم بودند. کم‌ترین سطوح فاصله ژنتيكي بین گورخر و الاغ مشاهده شد که نشان‌دهنده نزدیکی روابط فیلوژنتیکی آنها است. بیشترین سطوح مقدار تمایز ژنتیکی بین اسب و گورخر مشاهده گردید
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 05 Dec 2018 07:42
Last Modified: 05 Dec 2018 07:42
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4124

Actions (login required)

View Item View Item