Investigation of Genetic structure in Ardabil native horses using Microsatellite Markers

Azadmard Jelodarloo, Elhameh and Hedayat Evrigh, Nemat and Seyedsharifi, Reza and Nikbin, Saeed and Shakoori, Mirdaryoush (2017) Investigation of Genetic structure in Ardabil native horses using Microsatellite Markers. In: 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017, Ardabil, Iran.

[img] Text
H-00235-AB-2.pdf

Download (511kB)
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

The aim of this study was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of native horses in Ardabil regions (Northern west of Iran)using microsatellite markers. Genomic DNA was extracted using the kit DNA purified from mammal blood in 63 horses of native breeds in rural and horse breeding club in Ardabil.Eight specific primers were used to amplify microsatellites locus and genotypes were determine using Polyacrylamide Gel Electrophoresis. Results showed that number of alleles in all sites were between 13-29 . in average we observed 19.38 alleles in all samples. Genetic differentiationamongmarkerswas 0.005-0.024 that indicate there are various protected between chromosomes. Hetozigositybetween markers were observed between 0.837 to 1 that were for LEX54 and LEX33 respectively. In average, observed Hetrozigosity in two populations was 0.931 and also, Shanon Index were between LEX54 (2.269) to COR058(3.235). that indicated high diversity in our samples.it might be the sample collection we observed High diversity observed in this study. Because we select the sample that wasn’t relationship with each other.

Item Type: Conference or Workshop Item (Poster)
Persian Title: بررسی ساختار جمعیت اسب های بومی استان اردبیل با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای
Persian Abstract: این مطالعه با هدف بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار ژنتیکی اسب های منطقه اردبیل با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای انجام شد.نمونه برداری از اسبهای مناطق مختلف استان اردبیل که شامل اسب های موجود در روستاها و باشگاههای پرورش اسب بود انجام گرفت و DNA ژنومی از با استفاده از کیت استخراج گردید و در نهایت با استفاده از هشت پرایمر اختصاصی جایگاه ریزماهواره ای تکثیر گردید و جهت تعیین ژنوتیپ هر کدام از جایگاهها از الکتروفورز بر روی ژل اکریا آمید استفاده شد. نتایج این مطالعه نشان داد که تعداد آلل های جایگاه های مورد نظر بین 13تا 29 متغییر بودندمیانگین تعداد آلل های مشاهده شده 938/19 بود و به طور کلی میزان تمایز ژنتیکی مارکرها بین 024/0-005/0 به دست آمد. بیشترین هتروزیگوسیتی مشاهده شده در جایگاه های LEX54/ASB02 با فراوانی 1 و کمترین هتروزیگوسیتی در جایگاه های LEX33/HMS03 با فراوانی 837/0 بدست آمد بطور کلی میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده در دو جمعیت 931/0 به دست آمد.بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون به ترتیب در جایگاه COR058 (235/3) و LEX54(269/2) برآورد گردید.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Divisions: Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Subjects > Conferences > 1st International and 5th National Conference on Organic vs. Conventional Agriculture, 16-17 August 2017
Date Deposited: 05 Dec 2018 07:15
Last Modified: 05 Dec 2018 07:15
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/4156

Actions (login required)

View Item View Item