The Study Of Chloroplast Genes Sequences, MatK, RbcL and TrnL-F in Salvia nemorosa L. and Thymus syriacus Boiss

Jahangiri, Maryam (2014) The Study Of Chloroplast Genes Sequences, MatK, RbcL and TrnL-F in Salvia nemorosa L. and Thymus syriacus Boiss. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img]
Preview
Text (بررسی توالی‌های ژن¬های کلروپلاستی matk، rbcL و trnL-F در Salvia nemorosa L. و Thymus syriacus Boiss.)
Maryam Jahangiri.pdf

Download (1MB) | Preview
Official URL: http://www.uma.ac.ir

Abstract

The plant family Lamiaceae contains several species with potential therapeutic activity due to their essential oils. DNA barcoding is the use of short DNA sequences of the standard segment of the genome for large scale species identification. In this study, the chloroplast genes of two species of the Lamiaceae family, Thymus syriacus and Salvia nemorosa were sequenced to make the identification of these two species quickly and accurately. In this study, the genes matK, rbcL were used for sequencing Thymus syriacus and matK, trnL-F for Salvia nemorosa.First, total genomic DNA was extracted from leaves. Second, the nucleotide sequences of chloroplast genes were amplified and finally were sequenced. Sequenced chloroplast genes can be used to compare between species in phylogenetic and evolutionary studies and could therefor provide more accurate results within a shorter time especially in large-scale studies. The results suggest that chloroplast regions as matK, rbcL and trnL-F can be used as DNA barcodes for identification of Salvia nemorosa and Thymus syriacus species. Keywords:DNA barcoding, DNA barcode, matK, rbcL, trnL-F

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی توالی‌های ژن¬های کلروپلاستی matk، rbcL و trnL-F در Salvia nemorosa L. و Thymus syriacus Boiss.
Persian Abstract: تیره Lamiaceae شامل چندین گونه با فعالیت‌های درمانی مختلف می‌باشد. خط‌شناسه گذاری DNA استفاده از توالیهای کوتاه DNA از قطعات استاندارد ژنوم برای شناسایی گونهها در سطح وسیع است. در این مطالعه ژن‌های کلروپلاستی دو گونه‌یSalvia nemorosa و Thymus syriacus از تیره Lamiaceae مورد تعیین توالی قرارگرفتند تا شناسایی این دو گونه را سریع‌تر و دقیق‌تر سازد. در این مطالعه از ژن‌هایmatK ، rbcL برای توالی‌یابی Thymus syriacus و matK ، trnL-F برای توالی‌یابی Salvia nemorosa استفاده شد. در ابتدا DNA این دو گونه از برگ‌ها استخراج شد. در مرحله‌ی دوم توالی‌های نوکلئوتیدی ژن‌های کلروپلاستی این دو گونه تکثیر شد و در نهایت توالی‌یابی شدند. توالی ژ‌‌ن‌های کلروپلاستی تعیین توالی شده می‌توانند در سایر مطالعات فیلوژنتیکی و تکاملی، جهت مقایسه‌ی بین گونه‌ها مورد استفاده قرار گیرند و نتایج دقیق‌تری را در مدت زمان کوتاه‌تر، بویژه در مطالعاتی در مقیاس وسیع‌تر فراهم کنند. نتایج نشان می‌دهد که نواحی کلروپلاستی matK، rbcL و trnL-F می‌توانند بعنوان بارکدهای DNA برای شناسایی گونه‌های Salvia nemorosa و Thymus syriacus مورد استفاده قرار گیرند. كليد واژه¬ها: خطشناسه گذاری DNA، خطشناسه، matK ، rbcL ، trnL-F
Supervisor:
SupervisorE-mail
Latifi-Navid, SaeidUNSPECIFIED
Saffar, BehnazUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Khrazian, NavazUNSPECIFIED
Zahri, SaberUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions: Subjects > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Date Deposited: 07 Oct 2018 08:28
Last Modified: 07 Oct 2018 08:28
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/472

Actions (login required)

View Item View Item