Evaluation of genetic diversity of medicinal mushroom Ganoderma lucidum using ISSR markers

Lotfi, Shabnam and Behnamian, Mahdi and Dezhsetan, Sara and Keypour, Somayeh and Ali Hoseinzadeh, Fateme (2017) Evaluation of genetic diversity of medicinal mushroom Ganoderma lucidum using ISSR markers. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text
شبنم لطفی 9345324102.pdf

Download (766kB)
Official URL: http://uma.ac.ir/

Abstract

Ganoderma lucidum, is a mushroom with many medicinal properties, distributed in several regions of the country. In this study, 37 strians of G. lucidum collected from Mazandaran, Gorgan and Gilan provinces in Iran, and genetic diversity was investigated among the populations by using 21 inter-simple sequence repeat (ISSR) primers. 15 out of the 21 ISSR primers generated 173 DNA bands with 100% polymorphism. The results showed that the average genetic diversity (HS), total genetic diversity (HT) and genetic differentiation (GST) were 0.2137, 0.3629 and 0.411, respectively. The frequency of polymorphism varied from 0 to 98.27% with an average of 58.09% across all populations. Polymorphic information content (PIC) was ranged from 0.294 to 0.469 (with an average of 0.407) and Nei’s gentic diversity, Shannon index and average genetic distance were 0.214, 0.317 and 0.278, respectively. Population clustering was performed based on UPGMA method and the studied populations were divided into nine main groups. In general, the result indicated that there was a favorable genetic diversity among collected Ganoderma lucidum strains.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی تنوع ژنتیکی قارچ دارویی گانودرما لوسیدوم (Ganoderma lucidum) با استفاده از نشانگرهای ISSR
Persian Abstract: گانودرما لوسیدوم قارچی با خواص دارویی فراوان بوده که در چند منطقه کشور پراکنش دارد. در این پژوهش 37 سویه قارچ گانودرما لوسیدوم از سه استان کشور (مازندران گرگان، گیلان) جمع‌آوری شده و سپس با 21 نشانگر ISSR تنوع ژنتیکی بین جمعیت¬ها با استفاده از 21 آغازگر ISSR بررسی شد. 15 آغازگر از 21 آغازگر مورد استفاده ISSR، 173 باند DNA قابل تشخیص با چند شکلی 100 درصد تولید کردند. نتایج نشان داد که میانگین تنوع ژنتیکی داخل جمعیت (HS)، تنوع ژنتیکی کل (HT) و تمایز ژنتیکی (GST) به ترتیب برابر با 21/0، 3629/0 و 411/0 بود. فراوانی چند شکلی در جمعیت‌های مورد مطالعه از صفر تا 27/98 درصد (با میانگین 09/58 درصد) متغیر بود. میزان اطلاعات چند شکلی بین نشانگرها از 294/0 تا 469/0 (با میانگین 407/0) متغیر بود و تنوع ژنتیکی نی، شاخص شانون و متوسط فاصله ژنتیکی نیز به ترتیب برابر با 214/0، 317/0 و 278/0 بود. خوشه¬بندی جمعیت¬ها فوق براساس روش UPGMA انجام گرفت و جمعیت‌های مورد مطالعه در 9 گروه اصلی قرار گرفتند. در مجموع، نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی مطلوبی بین سویه‌های جمع¬آوری شده قارچ گانودرما وجود داشت.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Behnamian, MahdiUNSPECIFIED
Dezhsetan, SaraUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Keypour, SomayehUNSPECIFIED
Ali Hoseinzadeh, FatemeUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Horticulture
Date Deposited: 24 Jun 2019 04:51
Last Modified: 24 Jun 2019 04:51
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/6947

Actions (login required)

View Item View Item