Investigation of candidate gene affeced on economic milk traits in Khalkhali goat.

Zalpour, Somayeh and Hedayat Evrigh, Nemat and Behmaram, Reza and Seyed Sharifi, Reza and Navidshad, Bahman (2017) Investigation of candidate gene affeced on economic milk traits in Khalkhali goat. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text
سمیه زال پور 9433764109.pdf

Download (1MB)
Official URL: http://uma.ac.ir/

Abstract

Improving indigenous populations is one of the major concerns of breeding and retention centers. Khalkhali goat is one of the most important Iranian breeds in Iran, whose economic recovery needs breeding. The purpose of this study was to detect mutations in two candidate genes (beta-lactoglobulin and POU1F1) on the economic traits of milk in khllkhali goats. To do this, a sample of 100 goats was identified and genotypes were determined using PCR-SSCP. Mutations were identified using trench sequencing and Mega 6.0 and DnaSp 5.1 software.The identified effects on the important economic traits were analyzed using SAS 9.1 software. The beta-lactoglobulin gene using sscp showed 3 different patterns and the mutations detected at positions 83 and 126 were of the type of deletion and addition that were removed at the first position and added A, and at the second position, the deletion and addition of G at the replacement position 361 A to C was observed.The mutations produced 3 haplotypes with no haplotypes having significant effect on birth weight, but haplotype 3 had significant effects on the weight of the digesting devices on the traits and components of milk, the percentage of milk fat, protein and material percentages Solid had a significant effect.The results of analyzes in the POU1F1 gene, 7 mutations, and 4 haplotypes showed that mutations detected altered adenine to cytosine (A → C), adenine to cytosine (A → C), adenine to cytosine (A → C), adenine to cytosine A → C), adenine to cytosine (A → C), adenine to cytosine (A → C), adenine to guanine (A → G), at positions 63 -133-278-291-292-807 and 916 respectively.And the produced haplotypes had a significant effect on birth weight and weaning weight, and also a significant effect on fat percentage and protein percentage was observed in the analysis of mutations in milk components.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: شناسایی جهش‌های موجود در برخی از ژن‌های کاندیدا مؤثر بر صفات اقتصادی شیر در بزهای خلخالی
Persian Abstract: بهبود جمعیت‌های بومی یکی از دغدغه‌های مهم اصلاح نژاد و مراکز حفظ نژادی بشمار می‌رود. بز خلخالی یکی از نژادهای مهم شیری ایران است که بهبود اقتصادی این نژاد نیازمند اصلاح نژاد است. استفاده از ژن کاندیدا می‌تواند در اصلاح نژاد این بز بومی مثمر ثمر باشد. تحقیق حاضر با هدف شناسایی جهش‌های موجود در دو ژن کاندیدا (بتالاکتوگلوبولین و POU1F1) بر صفات اقتصادی شیر در بزهای خلخالی انجام گرفت. برای این کار از تعداد 100 رأس بز نمونه‌گیری به عمل آمد و با استفاده از PCR-SSCP تعیین ژنوتیپ شد و جهش‌ها با استفاده از توالی یابی سنگر و نرم‌افزارهایMega 6.0و DnaSp 5.1شناسایی شدند اثر جهش‌های شناسایی شده بر روی صفات مهم اقتصادی با استفاده از نرم‌افزارSAS 9.1 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. ژن بتالاکتوگلوبولین با استفاده از sscp، 3 الگوی متفاوت را نشان داد و جهش‌های شناسایی شده در جایگاه 83 و 126 از نوع حذف و اضافه بود که در جایگاه اول حذف و اضافه Aو در جایگاه دوم حذف و اضافه شدن G، در جایگاه 361 جایگزینی Aبه Cمشاهده شد جهش‌های ایجاد شده منجر به ایجاد 3 هاپلوتیپ گردید که هاپلوتیپ ها اثر معنی داری بر روی وزن تولد نداشتند ولی هاپلوتیپ 3 اثر معنی داری بر روی وزن شیرگیری داشت جهش‌های شناسایی شده بر روی صفات و اجزای شیر، درصد چربی شیر، درصد پروتئین ومواد جامد تأثیر معنی داری داشتند.نتایج آنالیزها در ژن POU1F1،منجر به شناسایی 7 جهش و 4 هاپلوتیپ گردید که جهش‌های شناسایی شده باعث جایگزینی آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به سیتوزین (A→C)، آدنین به گوانین (A→G) به ترتیب در جایگاه های 63-133-278-291-292-807 و 916 شد و هاپلوتیپ های ایجاد شده اثر معنی داری بر روی وزن تولد و وزن شیرگیری داشتند و همچنین در بررسی جهش‌ها در اجزای شیرفقط بر روی درصد چربی و درصد پروتئین تأثیر معنی دار مشاهده گردید. بررسی های انجام شده بر روی ژن بتالاکتوگلوبولین نشان داد که تأثیر معنی دار بر روی وزن تولد نداشت و در بررسی اجزا شیر جهش ها برروی صفات درصد چربی شیر، درصد پروتئین و موادجامد معنی دار است. برروی ژن pou1f1وزن تولد اثر معنی داری نشان نداد و جهش ها برروی صفات درصدچربی ودرصد پروتئین تأثیر معنی دار داشت.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Hedayat Evrigh, NematUNSPECIFIED
Behmaram, RezaUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Seyed Sharifi, RezaUNSPECIFIED
Navidshad, BahmanUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Date Deposited: 24 Jun 2019 05:13
Last Modified: 24 Jun 2019 05:13
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/6951

Actions (login required)

View Item View Item