Investigation of Genetic Structure Using Microsatellite Markers in Horse Populations At West-North of Iran

Azadmard Jelovdarlou, Elhameh and Hedayat Evrigh, Nemat and Seyed Sharifi, Reza and Nikbin, Saeid and Shakouri, Mirdaryoush (2017) Investigation of Genetic Structure Using Microsatellite Markers in Horse Populations At West-North of Iran. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text
الهامه آزاد مرد جلودار لو 9433764110.pdf

Download (513kB)
Official URL: http://uma.ac.ir/

Abstract

Iran is the cradle of horse races vast territory and origin.There is an unprecedented wealth in Iran with a history of the history of the civilization of the native horse world, which we should witness to the implementation of developmental plans for the genetic improvement of native horses. Due to the development of horse riding in our culture, the religion and the specific social conditions of its development are possible in the country. This study genetic diversity microsatellite markers were analyzed using horses northwest.Microsatellite markers useful for the identification of common genetic variation in research,therefore, COR082،COR071، LEX54، COR058، LEX33، HMS03، and ASB02HMS07microsatellite was used to identify the genetic diversity of different populations in the country. Samples were taken from 100 horses. The genomic DNA extracted using kits from mammalian blood extracted using 8 microsatellite markers was amplified to pieces, propagation products were loaded onto a vertical electrophoresis gel, after determining the genotype, statistical analysis was performed.In this study, a high level of allelic variation was observed, which could have occurred due to circumcision.the average number of observed alleles per site was 13.792.Most polymorphism related to COR082 place with an average of 16.833 and the lowest polymorphism at position COR071 with 10.333 respectively. Statistic Fst (distinction population) was the highest and lowest of the two positions ASB02 / COR071. the amount of . 058 and .033 showed that indicates good genetic differentiation in populations was examined.

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت اسب‌های شمال¬غرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره‌ای
Persian Abstract: سرزمین پهناور ایران مهد پرورش اسب و مبدأ نژادهای گوناگون است. در ایران ثروتی بی همتا با سابقه ای به طول تاریخ تمدن جهان اسب بومی وجود دارد که برای بهبود ژنتیکی اسب‌های بومی‌باید شاهد اجرا شدن برنامه های توسعه ای باشیم، با توجه به گسترش اسب سواری در فرهنگ ما، دین و شرایط اجتماعی خاص توسعه ی آن در کشور امکان پذیر است.لذادراین پژوهش به بررسی تنوع ژنتیکی اسب‌های شمالغرب با استفاده ازنشانگرهای ریزماهواره ای پرداخته شد.ریزماهواره ها یکی از نشانگرهای سومند و رایج در شناسایی تنوع ژنتیکی در تحقیقات می‌باشد از این رو از ریزماهواره های COR082،COR071، LEX54، COR058، LEX33، HMS03، ASB02و HMS07 برای شناسای تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف موجود در کشور استفاده شد. از 100 رأس اسب نمونه گیری به عمل آمد. سپس DNA ژنومی‌با استفاده از کیت استخراج از خون پستانداران استخراج و با استفاده از 8 نشانگر ریزماهواره ای ذکرشده به قطعات مورد نظر تکثیر گردید. محصولات حاصل از تکثیر بر روی ژل الکتروفورز عمودی بارگزاری شدند وبعد از تعیین ژنوتیپ مورد آنالیز آماری قرار گرفتند . میانگین تعداد آلل مشاهده شده به ازای هر جایگاه 729/13 به دست آمد. بیشترین چند شکلی مربوط به جایگاه COR082 با میانگین 833/16 و کمترین چندشکلی نیز در جایگاه COR071 با 333/10 مشاهده شد. آماره ی Fst (تمایز جمعیت ها) بیشترین و کمترین مقدار مربوط به دو جایگاه ASB02/COR071 بود که مقدار 058/0و 033/0 را نشان دادند که حاکی از تمایز ژنتیکی مناسب در جمعیت های مورد بررسی بود.آنالیز واریانس مولکولی نشان دادکه83 درصد از میزان واریانس مشاهده شده مربوط به واریانس فردی بوده و 16 درصد واریانس بین فردی است. که این نیز می‌تواند به دلیل انتخاب افراد غیر خویشاوند با فاصله ی بیشتر باشد که منجر به افزایش تنوع ژنتیکی داخل فرد شده است. بالاترین شاخص شانون در جمعیت بومی‌با مقدار 886/2 به دست آمد و کمترین میزان شاخص شانون در جمعیت دره شوری با میزان 926/1 برآورد شد.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Hedayat Evrigh, NematUNSPECIFIED
Seyed Sharifi, RezaUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
Nikbin, SaeidUNSPECIFIED
Shakouri, MirdaryoushUNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Divisions: Subjects > Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Faculty of Agricultural Sciences & Natural Resources > Department of Animal Sciences & Food Industries
Date Deposited: 24 Jun 2019 07:26
Last Modified: 24 Jun 2019 07:26
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/6965

Actions (login required)

View Item View Item