Investigation of the Relationship between babA2 and oipA Genes of Helicobacter Pylori with GastroinTestinal Diseases in Iran

Feili, Omolbanin and Zahri, Saber and Latifi Navid, Saeid (2018) Investigation of the Relationship between babA2 and oipA Genes of Helicobacter Pylori with GastroinTestinal Diseases in Iran. Masters thesis, University of Mohaghegh Ardabili.

[img] Text
ام البنین فیلی 9522364114.pdf

Download (447kB)
Official URL: http://uma.ac.ir/

Abstract

Research Aim: Helicobacter pylori (H. pylori) is recognized as a causative agent of non-atrophic gastritis (NAG), peptic ulcerations (PUs), and gastric cancer (GC).The blood group antigen-binding adhesion (BabA) and outer inflammatory protein (OipA) involved in H. pyloriadherence to gastric epithelial cells have been suggested to have a role in the pathogenesis of gastrointestinal disease.We here aimed to clarify the roles of the H. pyloribabA2 and oipA genotypes in development of severe gastrointestinal disease. Research method: A total of 319 strains were obtained by culturing gastric biopsy specimens; then genomic DNA was extracted from H. pylori -positive cultures gastric biopsy specimens and genotyped by PCR. Logistic regression was used to analyze association between variables. P<0.05 was considered statistically significant. Findings: Frequency of the babA2+, andoipA+genotypes in patients with PUs was 30.8%, and 96.2%, respectively, and in non-atrophic gastritis group (NAG) was 36.6%, and 70.3%, respectively. There was no significant relationship between presence of babA2 with PUs and NAG. Results of the logistic regression analysis showed thatthe oipA+ genotype wasstronglycorrelated with the risk of PUs, the OR was 10.537[95% confidence interval (CI), 2.470-44.954, P = 0.001]. Frequency of babA2 and oipAgenes in strains obtained from patients with GC (10.5%, and 47.4%, respectively) was lower than those with NAG strains. The presence of babA2 and oipA genes showed a significant negative relationship with the risk of GC in logistic regression analysis; with OR= 0.204 (95% CI= 0.099-0.420) and 0.379 (95% CI= 0.226-0.637), respectively. Conclusion:The oipA+ genotype

Item Type: Thesis (Masters)
Persian Title: بررسی ارتباط ژن‌های babA2 و oipA هلیکوباکترپیلوری با بیماری‌های گوارشیدر ایران
Persian Abstract: هدف:هلیکوباکتر پیلوری عامل اصلی گاستریت غیر آتروفی، زخم های گوارشی و سرطان معده می باشد.پروتئین اتصالی به آنتی ژن گروه خونی (BabA) و پروتئین التهاب خارجی (OipA) بعنوان دو پروتئین چسبنده به سلول های اپی¬تالیال معده هستند که در بیماری زایی و ایجاد بیماری های گوارشی نقش دارند. هدف ما تعیین نقش ژنوتیپ های babA2و oipAهلیکوباکترپیلوری در توسعه بیماری های گوارشی است. روش‌شناسی پژوهش:در کل 319 سویه از کشت نمونه های بیوپسی معده بیماران ایرانی بدست آمد، سپس استخراج DNA از سویه های هلیکوباکتر پیلوری و در ادامه تعیین ژنوتیپ با واکنش زنجیره‌ی پلیمرازی (PCR) انجام شد. آنالیز رگرسیون لجستیک برای آنالیز ارتباط هر کدام از متغیر ها با بیماری های گوارشی استفاده شد و P<0.05 بعنوان سطح معنی داری در نظر گرفته شد. یافته‌ها:فراونی ژنوتیپ های babA2+وoipA+ در بیماران زخم گوارشی به ترتیب برابر 8/30%و 2/96%بود و در بیماران گاستریت غیر آتروفی که بعنوان گروه کنترل هستند برابر با 6/36%و 3/70%بود. هیچ ارتباط معنی داری بین ژن babA2و خطر زخم گوارشی وجود نداشت (0.05 <P). نتایج آنالیز رگرسیون لجستیک نشان داد که ژنوتیپ oipA+قویا با خطر زخم گوارشی در ارتباط است ( 001/0=P)؛ (CI95%)OR برای oipA+ برابر با (954/44-470/2) 537/10 بود. فراوانی ژنوتیپ های babA2+وoipA+در سویه های بدست آمده از بیماران سرطان معده (به ترتیب 5/10%و 4/47%) نسبت به سویه های جدا شده از بیماران گاستریت غیرآتروفی پایین بود. آنالیز رگرسیون لجستیک نشان داد که حضور ژن های babA2 و oipAیک ارتباط معنی دار منفی (معکوس) با خطر سرطان معده داشت؛ (CI95%)OR به ترتیب برابر با (637/0-226/0) 379/0 ،000/0 = P و (420/0-099/0) 204/0 ،000/0 = P بود. نتیجه‌گیری:ژنوتیپ oipA+هلیکوباکترپیلوری می تواند بعنوان یک نشانگر زیستی برای پیشگویی خطر زخم گوارشی در ایران در نظر گرفته شود.
Supervisor:
SupervisorE-mail
Zahri, SaberUNSPECIFIED
Latifi Navid, SaeidUNSPECIFIED
Advisor:
AdvisorE-mail
-, -UNSPECIFIED
Subjects: Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Divisions: Subjects > Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Faculty of Basic Sciences > Department of Biology
Date Deposited: 01 Jul 2019 05:12
Last Modified: 01 Jul 2019 05:12
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/7156

Actions (login required)

View Item View Item