صفری, مهدی and قنبری, علیرضا and ترابی گیگلو, موسی and استاجی, اصغر Evaluation of Genetic Diversity in Prunusspinosa L. using ISSR markers. In: 2nd International and 6th National Iranian Congress on Organic vs. Conventional Agriculture, August 2019, Ardabil, Iran.
![[img]](http://repository.uma.ac.ir/style/images/fileicons/text.png) |
Text
J-00126-AB.pdf Download (782kB) |
Abstract
Blackthorn (Prunusspinosa L.) is belonging to the Rosacea family and Prunus genus. The young leaves were collected from twenty eight selected genotypes in Germi forests of Ardebil province. DNA extraction from leaves samples achieved by modified CTAB method, and then amplified by six primers. According to obtained results, the number of amplified band were nineteen with 3.16 average. Also, the highest and lowest numbers of amplified bands were obtained using Primers ISSR-12 (six bands) and ISSR-10 and ISSR-15 (twobands) respectively.The polymorphic information content (PIC) showed that ISSR-12 was the highest (0.44). In this study, mean of Shannon information index, effective number of alleles, observed number of alleles and coefficient of Nei diversity were 0.45, 7, 5 and 0.29 respectively.Cluster analysis by WARD algorithm and Dies similarity matrix, divided the genotypes into four main groups.
| Item Type: | Conference or Workshop Item (Lecture) |
|---|---|
| Persian Title: | ارزیابی تنوع ژنتیکی گیاه گوجه وحشی خاردار (Prunus spinosaL.) با استفاده از نشانگرهای مولکولیISSR |
| Persian Abstract: | گوجه¬ی وحشی خاردار با نام علمیPrunus spinose L. متعلق به تیره گل سرخ (Rosaceae) و جنس آلوها (Pruns) است. برگ-های جوان از 28 نمونه بوته¬های انتخابی از جنگل¬های شهرستان گرمی در استان اردبیل جمع¬آوری گردید. استخراج DNA از نمونه¬های برگی با استفاده از روش CTAB تغییر یافته انجام و با استفاده از 6 آغازگر ISSR تکثیر یافت. با توجه به نتایج بدست آمده، تعداد نوارهای ایجاد شده 19عدد بود که 16/3 نوار به نسبت هر آغازگر بوده است. هم¬چنین بیش¬ترین و کم¬ترین تعداد باند تکثیر شده به ترتیب توسط آغازگرISSR12 (شش باند) و آغازگرهایISSR10 وISSR15 (دو باند) بوده است. میزان اطلاعات چندشکلی به¬دست آمده نشان داد که بیش¬ترین چندشکلی مربوط به آغازگرISSR12 با 44/0 بوده است. شاخص اطلاعاتی شانون، تعداد آلل¬های مشاهده شده، تعداد آلل¬های موثر و شاخص تنوع ژنی نی، به ترتیب 45/0، 7، 1/5 و 29/0 محاسبه گردید. تجزیه خوشه¬ای با استفاده از الگوریتم WARD محاسبه و رسم گردید و دندروگرام تجزیه خوشه¬ای ژنوتیپ¬ها را به 4 گروه تقسم نمود. |
| Subjects: | Divisions > Conferences > 2nd International and 6th National Iranian Congress on Organic vs. Conventional Agriculture - August 2019 Conferences > 2nd International and 6th National Iranian Congress on Organic vs. Conventional Agriculture - August 2019 |
| Divisions: | Conferences > 2nd International and 6th National Iranian Congress on Organic vs. Conventional Agriculture - August 2019 Subjects > Conferences > 2nd International and 6th National Iranian Congress on Organic vs. Conventional Agriculture - August 2019 |
| Date Deposited: | 22 Aug 2019 08:05 |
| Last Modified: | 22 Aug 2019 08:05 |
| URI: | http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/9426 |
Actions (login required)
 |
View Item |
