Identification of microsatellites for biodiversity analysis in the Bactrian camel

زارع ایوریق, ناهیده and هدایت, نعمت and سید شریفی, رضا and خلخالی, رضا and بوستان, آزاده Identification of microsatellites for biodiversity analysis in the Bactrian camel. In: 1st International Conference and the 4th National Conference on Conservation of Natural Resources and Environment, August 2019, Ardabil, Iran.

[img] Text
C-00133-AB.pdf

Download (501kB)

Abstract

Camels play a key role in providing of food for people in hot and cold deserts. Unlike the dromedary camels, the population size of Bactrian camels is small and in some countries, such as Iran, they are at risk of extinction. In this study, whole genomes of Bactrian camel were sequence using Illumina Hiseq 2000 and assembled. To identify microsatellite markers, we use MISA program with some restriction. The results caused to identify 45753 microsatellite markers in Bactrain camels, which include 3 MB of camel genome similar to others mammalian. Regards to identification of affective microsatellite in this study, we could organized a suitable strategy to management of inbreeding level in the residual population that could help us to improve biodiversity in Bactrian camel.

Item Type: Conference or Workshop Item (Lecture)
Persian Title: شناسایی نشانگرهای ریزماهواره¬ای جهت استفاده تنوع زیستی در شتر های دو کوهانه
Persian Abstract: شترها نقشی کلیدی در تامین غذا برای مردمی دارند که در بیابان‌های سرد و گرم جهان زندگی می‌کنند. برخلاف شترهای تک‌کوهانه، اندازه جمعیت شترهای دوکوهانه کوچکتر بوده و در برخی کشورها مانند ایران، در خطر انقراض قرار دارند. در مطالعه حاضر ژنوم شتر های دو کوهانه توالی یابی و گردآوری گردید و پراکنش ریزماهواره ها مورد بررسی قرار گرفت. جهت انجام آزمایش توالی یابی کامل ژنوم با استفاده از پلتفرم ایلومینا انچام گردید سپس بعد از تعیین کیفیت و ارزیابی وضعیت توالیها، از برنامه MISA برای شناسایی ریز ماهواره های گسترده ژنوم استفاده شد. نتایج ارزیابی ها و آنالیزهای منجر به شناسایی 45753 ریزماهواره برای شترهای دوکوهانه گردید که تقریباً Mb 3 ژنوم شتر های دو کوهانه را تشکیل می دهد. که نتایج بدست آمده تقریبا مشابه سایر پستانداران می باشند. به توجه به شناسایی موثر نشانگرهای ریزماهوره ای می توان با طراحی استرانژی آمیزشی مناسب باعث کاهش هم خونی و متعاقبا افزایش تنوع زیستی شده و از انقراض احتمالی در آینده بخصوص در مورد گونه های در حال انقراض مانند شتر بهره جست.
Subjects: Divisions > Conferences > 1st International Conference and the 4th National Conference on Conservation of Natural Resources and Environment - August 2019
Conferences > 1st International Conference and the 4th National Conference on Conservation of Natural Resources and Environment - August 2019
Divisions: Conferences > 1st International Conference and the 4th National Conference on Conservation of Natural Resources and Environment - August 2019
Subjects > Conferences > 1st International Conference and the 4th National Conference on Conservation of Natural Resources and Environment - August 2019
Date Deposited: 24 Aug 2019 08:38
Last Modified: 24 Aug 2019 08:38
URI: http://repository.uma.ac.ir/id/eprint/9802

Actions (login required)

View Item View Item